In NEPO Missions geht es um den Erwerb elementarer Konzepte und Strukturen der Programmierung am Beispiel eines Mars-Rovers. Spielerinnen und Spieler können sich von einfacheren Anweisungen an den Roboter hin zu komplexeren, verschachtelten und von Rahmenbedingungen abhängigen Programmen vorarbeiten. Gleichzeitig wird elementares Wissen über Funktion und Zweck des Mars-Rovers vermittelt. Bei Erfolg führt der grafisch dreidimensional dargestellte Mars-Rover die vorher programmierten Schritte sichtbar aus, was nicht ganz an die Erfolgserlebnisse mit physischen Lernrobotern heranreicht, aber dennoch eine motivierende Belohnung darstellt.

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